公司工资分两部分发需视情况而定，未克扣拖欠则合法。依据《劳动法》，工资应按时足额支付，分开发放若不违反此原则且总额无误，即合法。否则，可能影响员工权益，如社保缴纳基数不准等。
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公司工资分两部分发，处理方式需视合同与法规。若合同有约定且不违反法规，可按约定处理；若无约定或存疑，应咨询劳动部门或律师，确保合法合规，避免纠纷。
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工资分两部分发需谨慎。1.检查劳动合同，看是否有相关约定，确保发放方式合法。2.核实工资总额，银行与微信转账总和应与应得工资一致。3.若发现克扣或拖欠，及时与公司沟通，必要时向劳动监察部门投诉。4.保留所有工资发放记录，作为维权证据。